《BEM ～BECOME HUMAN～》讲述纪念电视动画《妖怪人间 BEM》50周年的重启版动画《妖怪人类贝姆（BEM）》，故事舞台发生在港湾都市Libra City，如同其名，这座城市以一座大桥划分为二，一边是繁华的顶区，一边是充斥犯罪、贪污，人们互相猜疑的底区。主角索妮亚是被派遣至底区的年轻女刑警。古道热肠、刚正不阿的她，在调查犯罪事件中，发现可能是受到改造的人类所为。索妮亚光凭一己之力，难以和改造人抗衡，几次遭遇危机都被来路不明的人形妖怪所救。他们其实是被人类研发出来的产物，梦想能成为人类，且借用了已亡故的人类身躯，潜伏在世间生活；绅士外貌的贝姆、青春女高中生贝菈、刀子口豆腐心的少年贝罗，三位暗黑英雄深信帮助人类，就有机会成为人类。他们和索妮亚携手合作，在象征两极的城市中，上演一场又一场紧张刺激的冒险故事。在此同时隐形议会也开始策划行动，企图逮住贝姆等人......。剧场版中描述持续在追查贝姆下落的索妮亚，在某间制药公司中发现了和贝姆长得一模一样的人。